Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CAPN3P20807 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN3P20807 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN3P20807 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN3P20807 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CAPN3P20807 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CAPN3P20807 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CAPN3P20807 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN3P20807 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CAPN3P20807 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
CAPN3P20807 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CAPN3P20807 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CAPN3P20807 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN3P20807 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CAPN3P20807 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN3P20807 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN3P20807 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
CAPN3P20807 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CAPN3P20807 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN3P20807 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN3P20807 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CAPN3P20807 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CAPN3P20807 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN3P20807 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CAPN3P20807 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPN3P20807 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPN3P20807 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPN3P20807 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN3P20807 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPN3P20807 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN3P20807 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPN3P20807 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN3P20807 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPN3P20807 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPN3P20807 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN3P20807 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPN3P20807 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN3P20807 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPN3P20807 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN3P20807 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN3P20807 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN3P20807 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CAPN3P20807 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN3P20807 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPN3P20807 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN3P20807 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN3P20807 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN3P20807 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPN3P20807 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN3P20807 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPN3P20807 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPN3P20807 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPN3P20807 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPN3P20807 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPN3P20807 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN3P20807 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN3P20807 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPN3P20807 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN3P20807 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPN3P20807 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPN3P20807 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN3P20807 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPN3P20807 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN3P20807 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN3P20807 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
CAPN3P20807 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
CAPN3P20807 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN3P20807 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
CAPN3P20807 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN3P20807 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN3P20807 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
CAPN3P20807 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
CAPN3P20807 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CAPN3P20807 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms