Protein–RNA interactions for Protein: P19338

NCL, Nucleolin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCLP19338 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
NCLP19338 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
NCLP19338 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
NCLP19338 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
NCLP19338 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NCLP19338 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NCLP19338 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NCLP19338 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NCLP19338 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NCLP19338 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NCLP19338 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
NCLP19338 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NCLP19338 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
NCLP19338 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NCLP19338 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
NCLP19338 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NCLP19338 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.47■■■□□ 2.79
NCLP19338 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCLP19338 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
NCLP19338 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NCLP19338 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NCLP19338 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
NCLP19338 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCLP19338 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCLP19338 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
NCLP19338 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
NCLP19338 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCLP19338 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCLP19338 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
NCLP19338 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCLP19338 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
NCLP19338 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCLP19338 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCLP19338 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
NCLP19338 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCLP19338 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
NCLP19338 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
NCLP19338 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCLP19338 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
NCLP19338 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
NCLP19338 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NCLP19338 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
NCLP19338 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
NCLP19338 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
NCLP19338 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
NCLP19338 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCLP19338 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
NCLP19338 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCLP19338 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
NCLP19338 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NCLP19338 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCLP19338 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NCLP19338 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NCLP19338 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NCLP19338 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
NCLP19338 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCLP19338 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NCLP19338 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NCLP19338 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCLP19338 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
NCLP19338 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NCLP19338 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
NCLP19338 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.73
NCLP19338 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
NCLP19338 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCLP19338 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
NCLP19338 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
NCLP19338 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
NCLP19338 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
NCLP19338 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCLP19338 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCLP19338 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
NCLP19338 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
NCLP19338 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.72
NCLP19338 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
NCLP19338 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
NCLP19338 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
NCLP19338 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
NCLP19338 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
NCLP19338 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
NCLP19338 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NCLP19338 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
NCLP19338 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NCLP19338 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NCLP19338 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCLP19338 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCLP19338 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCLP19338 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
NCLP19338 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NCLP19338 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NCLP19338 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
NCLP19338 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCLP19338 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
NCLP19338 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCLP19338 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
NCLP19338 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NCLP19338 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
NCLP19338 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCLP19338 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NCLP19338 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms