Protein–RNA interactions for Protein: P17936

IGFBP3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGFBP3P17936 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
IGFBP3P17936 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGFBP3P17936 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGFBP3P17936 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGFBP3P17936 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGFBP3P17936 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGFBP3P17936 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
IGFBP3P17936 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGFBP3P17936 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGFBP3P17936 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGFBP3P17936 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
IGFBP3P17936 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGFBP3P17936 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IGFBP3P17936 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGFBP3P17936 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IGFBP3P17936 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGFBP3P17936 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IGFBP3P17936 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IGFBP3P17936 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
IGFBP3P17936 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IGFBP3P17936 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGFBP3P17936 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IGFBP3P17936 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGFBP3P17936 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IGFBP3P17936 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IGFBP3P17936 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGFBP3P17936 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IGFBP3P17936 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGFBP3P17936 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IGFBP3P17936 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IGFBP3P17936 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IGFBP3P17936 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGFBP3P17936 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGFBP3P17936 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGFBP3P17936 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
IGFBP3P17936 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
IGFBP3P17936 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
IGFBP3P17936 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGFBP3P17936 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGFBP3P17936 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
IGFBP3P17936 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
IGFBP3P17936 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
IGFBP3P17936 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGFBP3P17936 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
IGFBP3P17936 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGFBP3P17936 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGFBP3P17936 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
IGFBP3P17936 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
IGFBP3P17936 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
IGFBP3P17936 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
IGFBP3P17936 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
IGFBP3P17936 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
IGFBP3P17936 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGFBP3P17936 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGFBP3P17936 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGFBP3P17936 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
IGFBP3P17936 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
IGFBP3P17936 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGFBP3P17936 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGFBP3P17936 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
IGFBP3P17936 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
IGFBP3P17936 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGFBP3P17936 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGFBP3P17936 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
IGFBP3P17936 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGFBP3P17936 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
IGFBP3P17936 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
IGFBP3P17936 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
IGFBP3P17936 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
IGFBP3P17936 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
IGFBP3P17936 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
IGFBP3P17936 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
IGFBP3P17936 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGFBP3P17936 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGFBP3P17936 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
IGFBP3P17936 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms