Protein–RNA interactions for Protein: P17050

NAGA, Alpha-N-acetylgalactosaminidase, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGAP17050 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NAGAP17050 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NAGAP17050 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NAGAP17050 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NAGAP17050 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAGAP17050 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NAGAP17050 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NAGAP17050 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NAGAP17050 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NAGAP17050 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAGAP17050 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAGAP17050 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
NAGAP17050 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NAGAP17050 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAGAP17050 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NAGAP17050 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAGAP17050 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NAGAP17050 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAGAP17050 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NAGAP17050 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NAGAP17050 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAGAP17050 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NAGAP17050 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NAGAP17050 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NAGAP17050 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAGAP17050 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NAGAP17050 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NAGAP17050 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NAGAP17050 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NAGAP17050 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAGAP17050 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAGAP17050 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NAGAP17050 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NAGAP17050 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAGAP17050 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NAGAP17050 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NAGAP17050 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAGAP17050 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NAGAP17050 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAGAP17050 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NAGAP17050 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAGAP17050 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NAGAP17050 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAGAP17050 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NAGAP17050 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAGAP17050 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAGAP17050 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NAGAP17050 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAGAP17050 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAGAP17050 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NAGAP17050 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NAGAP17050 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NAGAP17050 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NAGAP17050 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAGAP17050 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NAGAP17050 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NAGAP17050 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAGAP17050 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAGAP17050 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGAP17050 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGAP17050 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGAP17050 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGAP17050 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAGAP17050 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGAP17050 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGAP17050 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGAP17050 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGAP17050 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NAGAP17050 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGAP17050 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGAP17050 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGAP17050 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGAP17050 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGAP17050 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGAP17050 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGAP17050 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGAP17050 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGAP17050 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGAP17050 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAGAP17050 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAGAP17050 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAGAP17050 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAGAP17050 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAGAP17050 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAGAP17050 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAGAP17050 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAGAP17050 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAGAP17050 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAGAP17050 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAGAP17050 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAGAP17050 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAGAP17050 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
NAGAP17050 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
NAGAP17050 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
NAGAP17050 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAGAP17050 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NAGAP17050 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAGAP17050 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAGAP17050 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
NAGAP17050 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms