Protein–RNA interactions for Protein: P15259

PGAM2, Phosphoglycerate mutase 2, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM2P15259 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM2P15259 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PGAM2P15259 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAM2P15259 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PGAM2P15259 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGAM2P15259 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PGAM2P15259 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PGAM2P15259 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PGAM2P15259 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAM2P15259 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PGAM2P15259 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PGAM2P15259 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PGAM2P15259 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAM2P15259 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAM2P15259 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PGAM2P15259 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM2P15259 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PGAM2P15259 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM2P15259 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PGAM2P15259 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PGAM2P15259 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM2P15259 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PGAM2P15259 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PGAM2P15259 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PGAM2P15259 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM2P15259 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM2P15259 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PGAM2P15259 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PGAM2P15259 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAM2P15259 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAM2P15259 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAM2P15259 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PGAM2P15259 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAM2P15259 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PGAM2P15259 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PGAM2P15259 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PGAM2P15259 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PGAM2P15259 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PGAM2P15259 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PGAM2P15259 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms