Protein–RNA interactions for Protein: P13995

MTHFD2, Bifunctional methylenetetrahydrofolate dehydrogenase/cyclohydrolase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFD2P13995 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MTHFD2P13995 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTHFD2P13995 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MTHFD2P13995 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MTHFD2P13995 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MTHFD2P13995 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFD2P13995 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFD2P13995 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFD2P13995 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MTHFD2P13995 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFD2P13995 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFD2P13995 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
MTHFD2P13995 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFD2P13995 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MTHFD2P13995 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MTHFD2P13995 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTHFD2P13995 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTHFD2P13995 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MTHFD2P13995 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD2P13995 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
MTHFD2P13995 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
MTHFD2P13995 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTHFD2P13995 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
MTHFD2P13995 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTHFD2P13995 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MTHFD2P13995 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
MTHFD2P13995 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFD2P13995 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MTHFD2P13995 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFD2P13995 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFD2P13995 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFD2P13995 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MTHFD2P13995 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MTHFD2P13995 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MTHFD2P13995 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFD2P13995 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MTHFD2P13995 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MTHFD2P13995 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTHFD2P13995 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MTHFD2P13995 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFD2P13995 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
MTHFD2P13995 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MTHFD2P13995 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MTHFD2P13995 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MTHFD2P13995 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFD2P13995 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFD2P13995 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MTHFD2P13995 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
MTHFD2P13995 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
MTHFD2P13995 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27■■□□□ 1.91
MTHFD2P13995 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MTHFD2P13995 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MTHFD2P13995 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTHFD2P13995 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTHFD2P13995 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTHFD2P13995 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTHFD2P13995 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTHFD2P13995 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTHFD2P13995 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTHFD2P13995 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFD2P13995 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTHFD2P13995 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTHFD2P13995 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTHFD2P13995 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFD2P13995 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFD2P13995 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTHFD2P13995 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTHFD2P13995 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTHFD2P13995 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MTHFD2P13995 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTHFD2P13995 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTHFD2P13995 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTHFD2P13995 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTHFD2P13995 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFD2P13995 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFD2P13995 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTHFD2P13995 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTHFD2P13995 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTHFD2P13995 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTHFD2P13995 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTHFD2P13995 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTHFD2P13995 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
MTHFD2P13995 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTHFD2P13995 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
MTHFD2P13995 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms