Protein–RNA interactions for Protein: P12644

BMP4, Bone morphogenetic protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4P12644 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP4P12644 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP4P12644 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP4P12644 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
BMP4P12644 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
BMP4P12644 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BMP4P12644 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BMP4P12644 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
BMP4P12644 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP4P12644 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BMP4P12644 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BMP4P12644 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BMP4P12644 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP4P12644 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP4P12644 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP4P12644 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
BMP4P12644 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
BMP4P12644 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP4P12644 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP4P12644 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP4P12644 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP4P12644 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
BMP4P12644 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP4P12644 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP4P12644 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP4P12644 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
BMP4P12644 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP4P12644 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
BMP4P12644 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP4P12644 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
BMP4P12644 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP4P12644 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP4P12644 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
BMP4P12644 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP4P12644 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP4P12644 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP4P12644 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP4P12644 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
BMP4P12644 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
BMP4P12644 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP4P12644 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
BMP4P12644 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
BMP4P12644 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
BMP4P12644 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
BMP4P12644 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
BMP4P12644 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP4P12644 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP4P12644 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
BMP4P12644 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
BMP4P12644 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BMP4P12644 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP4P12644 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BMP4P12644 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BMP4P12644 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BMP4P12644 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP4P12644 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP4P12644 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP4P12644 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BMP4P12644 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BMP4P12644 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP4P12644 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BMP4P12644 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP4P12644 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP4P12644 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP4P12644 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP4P12644 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BMP4P12644 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BMP4P12644 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
BMP4P12644 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
BMP4P12644 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
BMP4P12644 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
BMP4P12644 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
BMP4P12644 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
BMP4P12644 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
BMP4P12644 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP4P12644 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP4P12644 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP4P12644 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
BMP4P12644 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
BMP4P12644 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP4P12644 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
BMP4P12644 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP4P12644 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP4P12644 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP4P12644 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
BMP4P12644 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BMP4P12644 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BMP4P12644 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BMP4P12644 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP4P12644 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BMP4P12644 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP4P12644 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP4P12644 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP4P12644 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BMP4P12644 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP4P12644 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP4P12644 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP4P12644 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BMP4P12644 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BMP4P12644 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms