Protein–RNA interactions for Protein: P12544

GZMA, Granzyme A, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMAP12544 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GZMAP12544 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GZMAP12544 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GZMAP12544 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GZMAP12544 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GZMAP12544 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GZMAP12544 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GZMAP12544 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GZMAP12544 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GZMAP12544 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GZMAP12544 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GZMAP12544 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GZMAP12544 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GZMAP12544 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GZMAP12544 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GZMAP12544 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GZMAP12544 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GZMAP12544 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GZMAP12544 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
GZMAP12544 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GZMAP12544 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GZMAP12544 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GZMAP12544 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GZMAP12544 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GZMAP12544 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GZMAP12544 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GZMAP12544 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GZMAP12544 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GZMAP12544 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
GZMAP12544 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GZMAP12544 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GZMAP12544 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GZMAP12544 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
GZMAP12544 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
GZMAP12544 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GZMAP12544 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
GZMAP12544 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
GZMAP12544 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
GZMAP12544 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
GZMAP12544 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
GZMAP12544 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
GZMAP12544 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
GZMAP12544 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
GZMAP12544 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
GZMAP12544 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
GZMAP12544 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GZMAP12544 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
GZMAP12544 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
GZMAP12544 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GZMAP12544 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GZMAP12544 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GZMAP12544 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GZMAP12544 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GZMAP12544 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GZMAP12544 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GZMAP12544 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GZMAP12544 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GZMAP12544 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GZMAP12544 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GZMAP12544 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GZMAP12544 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GZMAP12544 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GZMAP12544 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GZMAP12544 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GZMAP12544 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GZMAP12544 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GZMAP12544 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GZMAP12544 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GZMAP12544 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GZMAP12544 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GZMAP12544 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GZMAP12544 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GZMAP12544 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
GZMAP12544 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GZMAP12544 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GZMAP12544 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GZMAP12544 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GZMAP12544 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GZMAP12544 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GZMAP12544 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GZMAP12544 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GZMAP12544 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
GZMAP12544 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
GZMAP12544 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
GZMAP12544 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
GZMAP12544 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
GZMAP12544 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
GZMAP12544 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
GZMAP12544 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GZMAP12544 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
GZMAP12544 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
GZMAP12544 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
GZMAP12544 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
GZMAP12544 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.22
GZMAP12544 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
GZMAP12544 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
GZMAP12544 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GZMAP12544 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GZMAP12544 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
GZMAP12544 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms