Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RALAP11233 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RALAP11233 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RALAP11233 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RALAP11233 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RALAP11233 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RALAP11233 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RALAP11233 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
RALAP11233 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RALAP11233 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RALAP11233 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
RALAP11233 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RALAP11233 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
RALAP11233 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
RALAP11233 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
RALAP11233 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RALAP11233 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RALAP11233 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
RALAP11233 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
RALAP11233 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
RALAP11233 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
RALAP11233 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RALAP11233 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
RALAP11233 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RALAP11233 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
RALAP11233 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RALAP11233 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RALAP11233 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
RALAP11233 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RALAP11233 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
RALAP11233 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
RALAP11233 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RALAP11233 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
RALAP11233 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RALAP11233 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
RALAP11233 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
RALAP11233 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
RALAP11233 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RALAP11233 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
RALAP11233 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RALAP11233 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RALAP11233 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
RALAP11233 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
RALAP11233 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
RALAP11233 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RALAP11233 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
RALAP11233 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
RALAP11233 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
RALAP11233 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RALAP11233 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
RALAP11233 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
RALAP11233 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
RALAP11233 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
RALAP11233 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
RALAP11233 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RALAP11233 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
RALAP11233 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
RALAP11233 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RALAP11233 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
RALAP11233 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
RALAP11233 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
RALAP11233 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
RALAP11233 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RALAP11233 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
RALAP11233 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RALAP11233 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
RALAP11233 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
RALAP11233 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
RALAP11233 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RALAP11233 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
RALAP11233 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
RALAP11233 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
RALAP11233 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RALAP11233 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
RALAP11233 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
RALAP11233 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RALAP11233 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RALAP11233 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
RALAP11233 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
RALAP11233 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RALAP11233 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RALAP11233 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RALAP11233 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
RALAP11233 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
RALAP11233 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RALAP11233 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RALAP11233 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RALAP11233 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
RALAP11233 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
RALAP11233 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RALAP11233 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RALAP11233 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RALAP11233 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RALAP11233 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RALAP11233 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RALAP11233 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RALAP11233 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
RALAP11233 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RALAP11233 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RALAP11233 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms