Protein–RNA interactions for Protein: P10828

THRB, Thyroid hormone receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRBP10828 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRBP10828 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THRBP10828 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THRBP10828 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
THRBP10828 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
THRBP10828 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THRBP10828 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
THRBP10828 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
THRBP10828 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
THRBP10828 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
THRBP10828 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
THRBP10828 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRBP10828 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRBP10828 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRBP10828 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRBP10828 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
THRBP10828 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRBP10828 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
THRBP10828 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
THRBP10828 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
THRBP10828 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRBP10828 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRBP10828 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRBP10828 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
THRBP10828 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRBP10828 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
THRBP10828 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
THRBP10828 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
THRBP10828 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRBP10828 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
THRBP10828 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
THRBP10828 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
THRBP10828 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
THRBP10828 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
THRBP10828 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
THRBP10828 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRBP10828 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
THRBP10828 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
THRBP10828 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
THRBP10828 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
THRBP10828 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
THRBP10828 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRBP10828 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRBP10828 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
THRBP10828 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
THRBP10828 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
THRBP10828 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRBP10828 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
THRBP10828 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRBP10828 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
THRBP10828 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
THRBP10828 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
THRBP10828 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
THRBP10828 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
THRBP10828 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
THRBP10828 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRBP10828 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRBP10828 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRBP10828 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
THRBP10828 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRBP10828 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
THRBP10828 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
THRBP10828 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
THRBP10828 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRBP10828 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRBP10828 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
THRBP10828 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRBP10828 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRBP10828 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
THRBP10828 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRBP10828 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
THRBP10828 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
THRBP10828 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRBP10828 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRBP10828 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
THRBP10828 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
THRBP10828 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRBP10828 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
THRBP10828 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRBP10828 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRBP10828 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
THRBP10828 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
THRBP10828 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRBP10828 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
THRBP10828 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
THRBP10828 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRBP10828 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRBP10828 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
THRBP10828 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRBP10828 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRBP10828 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRBP10828 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRBP10828 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
THRBP10828 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRBP10828 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
THRBP10828 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
THRBP10828 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
THRBP10828 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
THRBP10828 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
THRBP10828 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms