Protein–RNA interactions for Protein: P10827

THRA, Thyroid hormone receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP10827 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
THRAP10827 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP10827 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
THRAP10827 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP10827 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP10827 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP10827 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
THRAP10827 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP10827 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
THRAP10827 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP10827 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
THRAP10827 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
THRAP10827 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
THRAP10827 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
THRAP10827 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
THRAP10827 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THRAP10827 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
THRAP10827 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.54■■■□□ 2
THRAP10827 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP10827 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP10827 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
THRAP10827 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
THRAP10827 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
THRAP10827 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
THRAP10827 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
THRAP10827 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
THRAP10827 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP10827 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
THRAP10827 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP10827 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP10827 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
THRAP10827 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
THRAP10827 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP10827 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP10827 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
THRAP10827 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP10827 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
THRAP10827 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
THRAP10827 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
THRAP10827 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
THRAP10827 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP10827 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP10827 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
THRAP10827 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
THRAP10827 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
THRAP10827 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
THRAP10827 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
THRAP10827 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP10827 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
THRAP10827 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP10827 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP10827 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
THRAP10827 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP10827 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
THRAP10827 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
THRAP10827 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
THRAP10827 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
THRAP10827 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP10827 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP10827 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
THRAP10827 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
THRAP10827 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP10827 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
THRAP10827 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP10827 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
THRAP10827 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THRAP10827 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
THRAP10827 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
THRAP10827 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
THRAP10827 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
THRAP10827 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
THRAP10827 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
THRAP10827 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
THRAP10827 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
THRAP10827 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
THRAP10827 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
THRAP10827 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP10827 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP10827 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP10827 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
THRAP10827 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
THRAP10827 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
THRAP10827 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
THRAP10827 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP10827 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP10827 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
THRAP10827 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP10827 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
THRAP10827 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
THRAP10827 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THRAP10827 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
THRAP10827 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
THRAP10827 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP10827 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP10827 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP10827 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
THRAP10827 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
THRAP10827 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
THRAP10827 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
THRAP10827 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms