Protein–RNA interactions for Protein: P10144

GZMB, Granzyme B, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GZMBP10144 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GZMBP10144 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GZMBP10144 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GZMBP10144 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GZMBP10144 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GZMBP10144 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GZMBP10144 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GZMBP10144 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GZMBP10144 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GZMBP10144 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GZMBP10144 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GZMBP10144 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GZMBP10144 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GZMBP10144 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GZMBP10144 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GZMBP10144 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GZMBP10144 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GZMBP10144 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GZMBP10144 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GZMBP10144 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
GZMBP10144 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GZMBP10144 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GZMBP10144 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GZMBP10144 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GZMBP10144 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GZMBP10144 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
GZMBP10144 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
GZMBP10144 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GZMBP10144 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
GZMBP10144 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GZMBP10144 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
GZMBP10144 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GZMBP10144 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GZMBP10144 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GZMBP10144 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GZMBP10144 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GZMBP10144 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GZMBP10144 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GZMBP10144 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GZMBP10144 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GZMBP10144 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GZMBP10144 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GZMBP10144 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GZMBP10144 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GZMBP10144 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GZMBP10144 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GZMBP10144 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GZMBP10144 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GZMBP10144 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GZMBP10144 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GZMBP10144 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GZMBP10144 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GZMBP10144 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GZMBP10144 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GZMBP10144 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
GZMBP10144 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GZMBP10144 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GZMBP10144 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GZMBP10144 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GZMBP10144 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GZMBP10144 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GZMBP10144 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GZMBP10144 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GZMBP10144 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GZMBP10144 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GZMBP10144 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GZMBP10144 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GZMBP10144 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GZMBP10144 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GZMBP10144 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GZMBP10144 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GZMBP10144 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GZMBP10144 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GZMBP10144 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GZMBP10144 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
GZMBP10144 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GZMBP10144 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
GZMBP10144 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
GZMBP10144 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GZMBP10144 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GZMBP10144 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
GZMBP10144 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
GZMBP10144 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GZMBP10144 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
GZMBP10144 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GZMBP10144 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
GZMBP10144 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GZMBP10144 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GZMBP10144 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
GZMBP10144 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
GZMBP10144 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
GZMBP10144 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GZMBP10144 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
GZMBP10144 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GZMBP10144 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GZMBP10144 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
GZMBP10144 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GZMBP10144 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
GZMBP10144 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
GZMBP10144 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms