Protein–RNA interactions for Protein: P0DN78

OPN1MW3, Medium-wave-sensitive opsin 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN1MW3P0DN78 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
OPN1MW3P0DN78 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
OPN1MW3P0DN78 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
OPN1MW3P0DN78 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1MW3P0DN78 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
OPN1MW3P0DN78 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1MW3P0DN78 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1MW3P0DN78 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
OPN1MW3P0DN78 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1MW3P0DN78 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1MW3P0DN78 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
OPN1MW3P0DN78 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
OPN1MW3P0DN78 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
OPN1MW3P0DN78 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
OPN1MW3P0DN78 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1MW3P0DN78 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
OPN1MW3P0DN78 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
OPN1MW3P0DN78 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1MW3P0DN78 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
OPN1MW3P0DN78 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
OPN1MW3P0DN78 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
OPN1MW3P0DN78 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
OPN1MW3P0DN78 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1MW3P0DN78 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1MW3P0DN78 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
OPN1MW3P0DN78 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN1MW3P0DN78 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN1MW3P0DN78 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
OPN1MW3P0DN78 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
OPN1MW3P0DN78 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN1MW3P0DN78 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
OPN1MW3P0DN78 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
OPN1MW3P0DN78 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
OPN1MW3P0DN78 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms