Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RD3LP0DJH9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RD3LP0DJH9 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3LP0DJH9 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RD3LP0DJH9 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
RD3LP0DJH9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3LP0DJH9 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3LP0DJH9 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RD3LP0DJH9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3LP0DJH9 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3LP0DJH9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RD3LP0DJH9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RD3LP0DJH9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3LP0DJH9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RD3LP0DJH9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RD3LP0DJH9 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RD3LP0DJH9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3LP0DJH9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RD3LP0DJH9 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3LP0DJH9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3LP0DJH9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RD3LP0DJH9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RD3LP0DJH9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RD3LP0DJH9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RD3LP0DJH9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RD3LP0DJH9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RD3LP0DJH9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RD3LP0DJH9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RD3LP0DJH9 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
RD3LP0DJH9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.8 ms