Protein–RNA interactions for Protein: P0CW71

HSMCR30, Putative metaphase chromosome protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSMCR30P0CW71 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
HSMCR30P0CW71 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HSMCR30P0CW71 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HSMCR30P0CW71 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HSMCR30P0CW71 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSMCR30P0CW71 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSMCR30P0CW71 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HSMCR30P0CW71 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSMCR30P0CW71 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HSMCR30P0CW71 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSMCR30P0CW71 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSMCR30P0CW71 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSMCR30P0CW71 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSMCR30P0CW71 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSMCR30P0CW71 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HSMCR30P0CW71 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HSMCR30P0CW71 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HSMCR30P0CW71 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSMCR30P0CW71 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSMCR30P0CW71 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HSMCR30P0CW71 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSMCR30P0CW71 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSMCR30P0CW71 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSMCR30P0CW71 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HSMCR30P0CW71 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HSMCR30P0CW71 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HSMCR30P0CW71 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSMCR30P0CW71 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HSMCR30P0CW71 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSMCR30P0CW71 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HSMCR30P0CW71 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSMCR30P0CW71 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HSMCR30P0CW71 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HSMCR30P0CW71 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HSMCR30P0CW71 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HSMCR30P0CW71 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HSMCR30P0CW71 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HSMCR30P0CW71 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HSMCR30P0CW71 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HSMCR30P0CW71 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HSMCR30P0CW71 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HSMCR30P0CW71 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HSMCR30P0CW71 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HSMCR30P0CW71 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HSMCR30P0CW71 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms