Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCDC166P0CW27 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC166P0CW27 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC166P0CW27 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC166P0CW27 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC166P0CW27 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC166P0CW27 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC166P0CW27 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC166P0CW27 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC166P0CW27 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC166P0CW27 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC166P0CW27 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC166P0CW27 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC166P0CW27 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC166P0CW27 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC166P0CW27 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC166P0CW27 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC166P0CW27 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC166P0CW27 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CCDC166P0CW27 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC166P0CW27 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC166P0CW27 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC166P0CW27 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC166P0CW27 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC166P0CW27 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC166P0CW27 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC166P0CW27 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CCDC166P0CW27 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC166P0CW27 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CCDC166P0CW27 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC166P0CW27 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CCDC166P0CW27 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CCDC166P0CW27 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CCDC166P0CW27 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC166P0CW27 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC166P0CW27 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CCDC166P0CW27 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
CCDC166P0CW27 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC166P0CW27 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC166P0CW27 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CCDC166P0CW27 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CCDC166P0CW27 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CCDC166P0CW27 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CCDC166P0CW27 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC166P0CW27 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CCDC166P0CW27 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CCDC166P0CW27 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC166P0CW27 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CCDC166P0CW27 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
CCDC166P0CW27 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CCDC166P0CW27 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC166P0CW27 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CCDC166P0CW27 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC166P0CW27 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CCDC166P0CW27 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CCDC166P0CW27 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CCDC166P0CW27 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC166P0CW27 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CCDC166P0CW27 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CCDC166P0CW27 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC166P0CW27 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CCDC166P0CW27 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CCDC166P0CW27 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CCDC166P0CW27 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC166P0CW27 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CCDC166P0CW27 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC166P0CW27 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CCDC166P0CW27 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC166P0CW27 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CCDC166P0CW27 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC166P0CW27 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC166P0CW27 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC166P0CW27 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC166P0CW27 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC166P0CW27 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms