Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W6

CCDC172, Coiled-coil domain-containing protein 172, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC172P0C7W6 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC172P0C7W6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC172P0C7W6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC172P0C7W6 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC172P0C7W6 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC172P0C7W6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC172P0C7W6 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC172P0C7W6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC172P0C7W6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC172P0C7W6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC172P0C7W6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC172P0C7W6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC172P0C7W6 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC172P0C7W6 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC172P0C7W6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC172P0C7W6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC172P0C7W6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC172P0C7W6 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CCDC172P0C7W6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC172P0C7W6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC172P0C7W6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC172P0C7W6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC172P0C7W6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC172P0C7W6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC172P0C7W6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CCDC172P0C7W6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CCDC172P0C7W6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC172P0C7W6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC172P0C7W6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CCDC172P0C7W6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CCDC172P0C7W6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CCDC172P0C7W6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC172P0C7W6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC172P0C7W6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC172P0C7W6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CCDC172P0C7W6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CCDC172P0C7W6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC172P0C7W6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CCDC172P0C7W6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CCDC172P0C7W6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC172P0C7W6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC172P0C7W6 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CCDC172P0C7W6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CCDC172P0C7W6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC172P0C7W6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CCDC172P0C7W6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC172P0C7W6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CCDC172P0C7W6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CCDC172P0C7W6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CCDC172P0C7W6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
CCDC172P0C7W6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
CCDC172P0C7W6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CCDC172P0C7W6 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
CCDC172P0C7W6 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC172P0C7W6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC172P0C7W6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CCDC172P0C7W6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CCDC172P0C7W6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
CCDC172P0C7W6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC172P0C7W6 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC172P0C7W6 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CCDC172P0C7W6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC172P0C7W6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC172P0C7W6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
CCDC172P0C7W6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CCDC172P0C7W6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC172P0C7W6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CCDC172P0C7W6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC172P0C7W6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
CCDC172P0C7W6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
CCDC172P0C7W6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CCDC172P0C7W6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
CCDC172P0C7W6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CCDC172P0C7W6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CCDC172P0C7W6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC172P0C7W6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC172P0C7W6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CCDC172P0C7W6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC172P0C7W6 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC172P0C7W6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC172P0C7W6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CCDC172P0C7W6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC172P0C7W6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CCDC172P0C7W6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CCDC172P0C7W6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CCDC172P0C7W6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CCDC172P0C7W6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC172P0C7W6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CCDC172P0C7W6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms