Protein–RNA interactions for Protein: P05114

HMGN1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN1P05114 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
HMGN1P05114 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HMGN1P05114 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGN1P05114 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HMGN1P05114 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGN1P05114 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HMGN1P05114 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGN1P05114 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HMGN1P05114 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HMGN1P05114 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGN1P05114 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGN1P05114 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HMGN1P05114 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGN1P05114 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HMGN1P05114 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGN1P05114 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGN1P05114 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HMGN1P05114 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGN1P05114 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
HMGN1P05114 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HMGN1P05114 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
HMGN1P05114 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGN1P05114 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HMGN1P05114 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HMGN1P05114 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HMGN1P05114 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGN1P05114 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HMGN1P05114 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HMGN1P05114 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HMGN1P05114 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HMGN1P05114 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HMGN1P05114 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGN1P05114 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HMGN1P05114 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HMGN1P05114 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGN1P05114 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGN1P05114 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HMGN1P05114 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HMGN1P05114 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGN1P05114 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGN1P05114 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGN1P05114 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HMGN1P05114 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HMGN1P05114 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HMGN1P05114 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGN1P05114 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HMGN1P05114 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HMGN1P05114 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGN1P05114 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGN1P05114 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HMGN1P05114 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGN1P05114 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HMGN1P05114 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HMGN1P05114 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HMGN1P05114 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HMGN1P05114 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGN1P05114 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HMGN1P05114 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HMGN1P05114 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HMGN1P05114 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HMGN1P05114 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HMGN1P05114 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HMGN1P05114 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGN1P05114 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HMGN1P05114 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HMGN1P05114 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGN1P05114 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HMGN1P05114 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HMGN1P05114 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms