Protein–RNA interactions for Protein: P03886

MT-ND1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-ND1P03886 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MT-ND1P03886 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MT-ND1P03886 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MT-ND1P03886 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MT-ND1P03886 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MT-ND1P03886 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MT-ND1P03886 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MT-ND1P03886 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MT-ND1P03886 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MT-ND1P03886 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MT-ND1P03886 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MT-ND1P03886 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MT-ND1P03886 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MT-ND1P03886 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MT-ND1P03886 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MT-ND1P03886 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MT-ND1P03886 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MT-ND1P03886 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MT-ND1P03886 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MT-ND1P03886 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MT-ND1P03886 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MT-ND1P03886 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MT-ND1P03886 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MT-ND1P03886 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MT-ND1P03886 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MT-ND1P03886 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MT-ND1P03886 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MT-ND1P03886 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MT-ND1P03886 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MT-ND1P03886 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MT-ND1P03886 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MT-ND1P03886 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MT-ND1P03886 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MT-ND1P03886 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
MT-ND1P03886 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MT-ND1P03886 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MT-ND1P03886 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MT-ND1P03886 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MT-ND1P03886 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MT-ND1P03886 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MT-ND1P03886 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MT-ND1P03886 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MT-ND1P03886 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MT-ND1P03886 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
MT-ND1P03886 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MT-ND1P03886 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MT-ND1P03886 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MT-ND1P03886 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MT-ND1P03886 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
MT-ND1P03886 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MT-ND1P03886 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-ND1P03886 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
MT-ND1P03886 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
MT-ND1P03886 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
MT-ND1P03886 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
MT-ND1P03886 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MT-ND1P03886 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
MT-ND1P03886 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MT-ND1P03886 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
MT-ND1P03886 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
MT-ND1P03886 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
MT-ND1P03886 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
MT-ND1P03886 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
MT-ND1P03886 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MT-ND1P03886 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
MT-ND1P03886 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MT-ND1P03886 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
MT-ND1P03886 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
MT-ND1P03886 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
MT-ND1P03886 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
MT-ND1P03886 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
MT-ND1P03886 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
MT-ND1P03886 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
MT-ND1P03886 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
MT-ND1P03886 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
MT-ND1P03886 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms