Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DQB1P01920 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLA-DQB1P01920 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DQB1P01920 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DQB1P01920 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DQB1P01920 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQB1P01920 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQB1P01920 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQB1P01920 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQB1P01920 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DQB1P01920 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DQB1P01920 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DQB1P01920 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DQB1P01920 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DQB1P01920 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLA-DQB1P01920 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLA-DQB1P01920 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DQB1P01920 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DQB1P01920 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLA-DQB1P01920 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DQB1P01920 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLA-DQB1P01920 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQB1P01920 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQB1P01920 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLA-DQB1P01920 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
HLA-DQB1P01920 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLA-DQB1P01920 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB1P01920 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLA-DQB1P01920 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQB1P01920 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQB1P01920 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HLA-DQB1P01920 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HLA-DQB1P01920 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HLA-DQB1P01920 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQB1P01920 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HLA-DQB1P01920 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HLA-DQB1P01920 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HLA-DQB1P01920 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB1P01920 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
HLA-DQB1P01920 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
HLA-DQB1P01920 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
HLA-DQB1P01920 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQB1P01920 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
HLA-DQB1P01920 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HLA-DQB1P01920 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQB1P01920 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQB1P01920 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HLA-DQB1P01920 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HLA-DQB1P01920 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB1P01920 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HLA-DQB1P01920 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HLA-DQB1P01920 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HLA-DQB1P01920 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DQB1P01920 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HLA-DQB1P01920 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DQB1P01920 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HLA-DQB1P01920 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HLA-DQB1P01920 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HLA-DQB1P01920 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DQB1P01920 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HLA-DQB1P01920 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HLA-DQB1P01920 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HLA-DQB1P01920 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DQB1P01920 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HLA-DQB1P01920 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DQB1P01920 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HLA-DQB1P01920 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DQB1P01920 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HLA-DQB1P01920 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HLA-DQB1P01920 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HLA-DQB1P01920 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HLA-DQB1P01920 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms