Protein–RNA interactions for Protein: P01906

HLA-DQA2, HLA class II histocompatibility antigen, DQ alpha 2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQA2P01906 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DQA2P01906 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HLA-DQA2P01906 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DQA2P01906 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DQA2P01906 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HLA-DQA2P01906 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HLA-DQA2P01906 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DQA2P01906 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HLA-DQA2P01906 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DQA2P01906 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HLA-DQA2P01906 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HLA-DQA2P01906 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HLA-DQA2P01906 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HLA-DQA2P01906 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HLA-DQA2P01906 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DQA2P01906 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HLA-DQA2P01906 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HLA-DQA2P01906 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQA2P01906 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HLA-DQA2P01906 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HLA-DQA2P01906 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQA2P01906 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQA2P01906 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HLA-DQA2P01906 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DQA2P01906 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DQA2P01906 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HLA-DQA2P01906 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQA2P01906 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HLA-DQA2P01906 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DQA2P01906 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DQA2P01906 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HLA-DQA2P01906 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HLA-DQA2P01906 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
HLA-DQA2P01906 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
HLA-DQA2P01906 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DQA2P01906 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HLA-DQA2P01906 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQA2P01906 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQA2P01906 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HLA-DQA2P01906 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQA2P01906 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HLA-DQA2P01906 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DQA2P01906 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HLA-DQA2P01906 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
HLA-DQA2P01906 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLA-DQA2P01906 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DQA2P01906 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DQA2P01906 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLA-DQA2P01906 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DQA2P01906 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLA-DQA2P01906 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLA-DQA2P01906 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DQA2P01906 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLA-DQA2P01906 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLA-DQA2P01906 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DQA2P01906 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLA-DQA2P01906 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DQA2P01906 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DQA2P01906 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLA-DQA2P01906 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLA-DQA2P01906 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms