Protein–RNA interactions for Protein: P01782

IGHV3-9, Immunoglobulin heavy variable 3-9, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-9P01782 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
IGHV3-9P01782 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
IGHV3-9P01782 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
IGHV3-9P01782 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
IGHV3-9P01782 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
IGHV3-9P01782 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IGHV3-9P01782 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IGHV3-9P01782 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IGHV3-9P01782 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IGHV3-9P01782 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHV3-9P01782 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHV3-9P01782 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHV3-9P01782 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHV3-9P01782 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IGHV3-9P01782 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGHV3-9P01782 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IGHV3-9P01782 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGHV3-9P01782 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IGHV3-9P01782 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
IGHV3-9P01782 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IGHV3-9P01782 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IGHV3-9P01782 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IGHV3-9P01782 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IGHV3-9P01782 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IGHV3-9P01782 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHV3-9P01782 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IGHV3-9P01782 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IGHV3-9P01782 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IGHV3-9P01782 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
IGHV3-9P01782 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
IGHV3-9P01782 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-9P01782 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
IGHV3-9P01782 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-9P01782 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-9P01782 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-9P01782 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
IGHV3-9P01782 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
IGHV3-9P01782 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
IGHV3-9P01782 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
IGHV3-9P01782 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-9P01782 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
IGHV3-9P01782 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV3-9P01782 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
IGHV3-9P01782 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-9P01782 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
IGHV3-9P01782 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
IGHV3-9P01782 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
IGHV3-9P01782 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
IGHV3-9P01782 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
IGHV3-9P01782 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGHV3-9P01782 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
IGHV3-9P01782 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.6 ms