Protein–RNA interactions for Protein: P00439

PAH, Phenylalanine-4-hydroxylase, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAHP00439 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAHP00439 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PAHP00439 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PAHP00439 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PAHP00439 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAHP00439 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PAHP00439 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
PAHP00439 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PAHP00439 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PAHP00439 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PAHP00439 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PAHP00439 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PAHP00439 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAHP00439 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAHP00439 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PAHP00439 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAHP00439 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PAHP00439 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PAHP00439 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAHP00439 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAHP00439 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PAHP00439 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PAHP00439 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PAHP00439 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PAHP00439 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAHP00439 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAHP00439 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAHP00439 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAHP00439 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAHP00439 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAHP00439 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAHP00439 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAHP00439 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAHP00439 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PAHP00439 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAHP00439 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PAHP00439 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAHP00439 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAHP00439 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAHP00439 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAHP00439 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAHP00439 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAHP00439 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PAHP00439 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAHP00439 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PAHP00439 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PAHP00439 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PAHP00439 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PAHP00439 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAHP00439 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PAHP00439 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAHP00439 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAHP00439 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAHP00439 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PAHP00439 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PAHP00439 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAHP00439 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAHP00439 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PAHP00439 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAHP00439 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAHP00439 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAHP00439 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PAHP00439 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAHP00439 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PAHP00439 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PAHP00439 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAHP00439 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAHP00439 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PAHP00439 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAHP00439 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PAHP00439 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PAHP00439 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PAHP00439 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAHP00439 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAHP00439 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAHP00439 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAHP00439 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAHP00439 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PAHP00439 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAHP00439 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PAHP00439 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PAHP00439 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PAHP00439 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAHP00439 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAHP00439 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAHP00439 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAHP00439 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAHP00439 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAHP00439 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAHP00439 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAHP00439 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAHP00439 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAHP00439 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PAHP00439 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAHP00439 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PAHP00439 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PAHP00439 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAHP00439 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAHP00439 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PAHP00439 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms