Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
MAP4K4O95819 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
MAP4K4O95819 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
MAP4K4O95819 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
MAP4K4O95819 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
MAP4K4O95819 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MAP4K4O95819 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
MAP4K4O95819 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
MAP4K4O95819 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MAP4K4O95819 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAP4K4O95819 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAP4K4O95819 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAP4K4O95819 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
MAP4K4O95819 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
MAP4K4O95819 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
MAP4K4O95819 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC34.04■■■■□ 3.04
MAP4K4O95819 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
MAP4K4O95819 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
MAP4K4O95819 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
MAP4K4O95819 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
MAP4K4O95819 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
MAP4K4O95819 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
MAP4K4O95819 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MAP4K4O95819 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
MAP4K4O95819 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
MAP4K4O95819 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
MAP4K4O95819 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
MAP4K4O95819 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP4K4O95819 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
MAP4K4O95819 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MAP4K4O95819 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
MAP4K4O95819 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
MAP4K4O95819 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
MAP4K4O95819 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
MAP4K4O95819 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
MAP4K4O95819 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MAP4K4O95819 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP4K4O95819 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP4K4O95819 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP4K4O95819 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP4K4O95819 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
MAP4K4O95819 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
MAP4K4O95819 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC33.82■■■■□ 3
MAP4K4O95819 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
MAP4K4O95819 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
MAP4K4O95819 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
MAP4K4O95819 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
MAP4K4O95819 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MAP4K4O95819 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
MAP4K4O95819 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
MAP4K4O95819 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
MAP4K4O95819 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC33.76■■■■□ 3
MAP4K4O95819 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
MAP4K4O95819 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP4K4O95819 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
MAP4K4O95819 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MAP4K4O95819 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MAP4K4O95819 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.73■■■□□ 2.99
MAP4K4O95819 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
MAP4K4O95819 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
MAP4K4O95819 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MAP4K4O95819 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
MAP4K4O95819 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
MAP4K4O95819 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP4K4O95819 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP4K4O95819 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MAP4K4O95819 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
MAP4K4O95819 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
MAP4K4O95819 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
MAP4K4O95819 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MAP4K4O95819 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MAP4K4O95819 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
MAP4K4O95819 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
MAP4K4O95819 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MAP4K4O95819 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
MAP4K4O95819 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
MAP4K4O95819 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
MAP4K4O95819 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MAP4K4O95819 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MAP4K4O95819 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
MAP4K4O95819 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP4K4O95819 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MAP4K4O95819 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
MAP4K4O95819 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
MAP4K4O95819 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC33.52■■■□□ 2.96
MAP4K4O95819 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
MAP4K4O95819 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP4K4O95819 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
MAP4K4O95819 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
MAP4K4O95819 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP4K4O95819 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP4K4O95819 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
MAP4K4O95819 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MAP4K4O95819 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
MAP4K4O95819 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
MAP4K4O95819 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.47■■■□□ 2.95
MAP4K4O95819 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
MAP4K4O95819 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
MAP4K4O95819 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
MAP4K4O95819 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms