Protein–RNA interactions for Protein: O95157

NXPH3, Neurexophilin-3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXPH3O95157 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NXPH3O95157 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NXPH3O95157 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH3O95157 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH3O95157 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH3O95157 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NXPH3O95157 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NXPH3O95157 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXPH3O95157 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPH3O95157 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPH3O95157 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPH3O95157 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXPH3O95157 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NXPH3O95157 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXPH3O95157 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NXPH3O95157 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NXPH3O95157 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NXPH3O95157 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXPH3O95157 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NXPH3O95157 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXPH3O95157 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NXPH3O95157 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NXPH3O95157 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXPH3O95157 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXPH3O95157 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXPH3O95157 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXPH3O95157 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NXPH3O95157 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NXPH3O95157 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NXPH3O95157 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NXPH3O95157 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NXPH3O95157 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NXPH3O95157 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NXPH3O95157 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPH3O95157 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPH3O95157 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPH3O95157 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPH3O95157 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NXPH3O95157 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NXPH3O95157 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NXPH3O95157 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NXPH3O95157 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPH3O95157 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NXPH3O95157 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH3O95157 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH3O95157 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NXPH3O95157 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms