Protein–RNA interactions for Protein: O94887

FARP2, FERM, RhoGEF and pleckstrin domain-containing protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARP2O94887 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
FARP2O94887 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
FARP2O94887 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FARP2O94887 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.18■■■□□ 2.74
FARP2O94887 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
FARP2O94887 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
FARP2O94887 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
FARP2O94887 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
FARP2O94887 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
FARP2O94887 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
FARP2O94887 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
FARP2O94887 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
FARP2O94887 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
FARP2O94887 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
FARP2O94887 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
FARP2O94887 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
FARP2O94887 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
FARP2O94887 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
FARP2O94887 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FARP2O94887 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
FARP2O94887 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
FARP2O94887 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
FARP2O94887 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
FARP2O94887 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
FARP2O94887 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
FARP2O94887 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
FARP2O94887 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FARP2O94887 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
FARP2O94887 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
FARP2O94887 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
FARP2O94887 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
FARP2O94887 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
FARP2O94887 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
FARP2O94887 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
FARP2O94887 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
FARP2O94887 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
FARP2O94887 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
FARP2O94887 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
FARP2O94887 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
FARP2O94887 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
FARP2O94887 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
FARP2O94887 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FARP2O94887 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
FARP2O94887 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
FARP2O94887 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
FARP2O94887 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
FARP2O94887 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
FARP2O94887 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.81■■■□□ 2.68
FARP2O94887 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
FARP2O94887 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
FARP2O94887 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FARP2O94887 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FARP2O94887 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
FARP2O94887 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
FARP2O94887 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
FARP2O94887 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
FARP2O94887 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FARP2O94887 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
FARP2O94887 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
FARP2O94887 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
FARP2O94887 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC31.73■■■□□ 2.67
FARP2O94887 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
FARP2O94887 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
FARP2O94887 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
FARP2O94887 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.67■■■□□ 2.66
FARP2O94887 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FARP2O94887 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
FARP2O94887 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
FARP2O94887 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
FARP2O94887 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.64■■■□□ 2.66
FARP2O94887 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FARP2O94887 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
FARP2O94887 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC31.6■■■□□ 2.65
FARP2O94887 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC31.59■■■□□ 2.65
FARP2O94887 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FARP2O94887 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
FARP2O94887 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FARP2O94887 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FARP2O94887 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FARP2O94887 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FARP2O94887 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FARP2O94887 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FARP2O94887 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
FARP2O94887 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.53■■■□□ 2.64
FARP2O94887 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FARP2O94887 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
FARP2O94887 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
FARP2O94887 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FARP2O94887 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FARP2O94887 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FARP2O94887 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FARP2O94887 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
FARP2O94887 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FARP2O94887 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FARP2O94887 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
FARP2O94887 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
FARP2O94887 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FARP2O94887 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FARP2O94887 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
FARP2O94887 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms