Protein–RNA interactions for Protein: O76038

SCGN, Secretagogin, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGNO76038 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SCGNO76038 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SCGNO76038 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SCGNO76038 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SCGNO76038 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCGNO76038 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SCGNO76038 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SCGNO76038 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SCGNO76038 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCGNO76038 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SCGNO76038 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCGNO76038 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SCGNO76038 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCGNO76038 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCGNO76038 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SCGNO76038 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCGNO76038 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCGNO76038 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCGNO76038 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCGNO76038 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCGNO76038 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCGNO76038 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCGNO76038 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCGNO76038 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCGNO76038 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCGNO76038 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCGNO76038 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCGNO76038 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCGNO76038 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SCGNO76038 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCGNO76038 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCGNO76038 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCGNO76038 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCGNO76038 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCGNO76038 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCGNO76038 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCGNO76038 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCGNO76038 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCGNO76038 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCGNO76038 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SCGNO76038 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCGNO76038 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCGNO76038 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCGNO76038 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCGNO76038 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCGNO76038 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCGNO76038 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCGNO76038 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCGNO76038 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCGNO76038 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCGNO76038 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCGNO76038 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCGNO76038 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCGNO76038 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCGNO76038 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCGNO76038 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCGNO76038 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCGNO76038 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCGNO76038 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCGNO76038 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCGNO76038 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCGNO76038 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCGNO76038 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCGNO76038 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCGNO76038 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCGNO76038 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCGNO76038 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SCGNO76038 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCGNO76038 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SCGNO76038 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SCGNO76038 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCGNO76038 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCGNO76038 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SCGNO76038 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCGNO76038 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SCGNO76038 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SCGNO76038 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SCGNO76038 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SCGNO76038 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCGNO76038 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SCGNO76038 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SCGNO76038 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCGNO76038 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCGNO76038 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SCGNO76038 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCGNO76038 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SCGNO76038 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCGNO76038 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCGNO76038 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SCGNO76038 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCGNO76038 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SCGNO76038 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCGNO76038 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SCGNO76038 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SCGNO76038 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCGNO76038 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SCGNO76038 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SCGNO76038 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCGNO76038 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SCGNO76038 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms