Protein–RNA interactions for Protein: O75880

SCO1, Protein SCO1 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCO1O75880 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCO1O75880 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCO1O75880 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCO1O75880 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCO1O75880 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCO1O75880 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCO1O75880 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCO1O75880 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCO1O75880 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCO1O75880 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SCO1O75880 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SCO1O75880 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO1O75880 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO1O75880 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SCO1O75880 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SCO1O75880 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCO1O75880 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SCO1O75880 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SCO1O75880 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCO1O75880 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SCO1O75880 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SCO1O75880 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCO1O75880 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SCO1O75880 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SCO1O75880 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCO1O75880 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SCO1O75880 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCO1O75880 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SCO1O75880 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SCO1O75880 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO1O75880 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO1O75880 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO1O75880 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SCO1O75880 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCO1O75880 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SCO1O75880 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SCO1O75880 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCO1O75880 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCO1O75880 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SCO1O75880 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCO1O75880 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SCO1O75880 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SCO1O75880 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCO1O75880 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SCO1O75880 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCO1O75880 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SCO1O75880 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCO1O75880 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCO1O75880 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCO1O75880 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SCO1O75880 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCO1O75880 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCO1O75880 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCO1O75880 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCO1O75880 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCO1O75880 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCO1O75880 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCO1O75880 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SCO1O75880 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCO1O75880 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCO1O75880 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCO1O75880 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCO1O75880 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO1O75880 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO1O75880 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCO1O75880 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO1O75880 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO1O75880 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCO1O75880 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCO1O75880 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCO1O75880 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCO1O75880 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO1O75880 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCO1O75880 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCO1O75880 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCO1O75880 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCO1O75880 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCO1O75880 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCO1O75880 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO1O75880 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO1O75880 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO1O75880 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO1O75880 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO1O75880 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCO1O75880 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCO1O75880 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCO1O75880 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCO1O75880 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCO1O75880 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCO1O75880 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCO1O75880 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCO1O75880 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SCO1O75880 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SCO1O75880 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCO1O75880 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SCO1O75880 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SCO1O75880 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCO1O75880 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SCO1O75880 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SCO1O75880 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.5 ms