Protein–RNA interactions for Protein: O75264

SMIM24, Small integral membrane protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM24O75264 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM24O75264 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM24O75264 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SMIM24O75264 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM24O75264 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SMIM24O75264 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM24O75264 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SMIM24O75264 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM24O75264 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SMIM24O75264 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SMIM24O75264 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
SMIM24O75264 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
SMIM24O75264 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SMIM24O75264 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM24O75264 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM24O75264 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM24O75264 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SMIM24O75264 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM24O75264 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM24O75264 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SMIM24O75264 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM24O75264 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMIM24O75264 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM24O75264 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM24O75264 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMIM24O75264 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMIM24O75264 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMIM24O75264 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM24O75264 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMIM24O75264 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SMIM24O75264 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM24O75264 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM24O75264 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM24O75264 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMIM24O75264 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMIM24O75264 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM24O75264 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMIM24O75264 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM24O75264 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM24O75264 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM24O75264 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM24O75264 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMIM24O75264 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM24O75264 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM24O75264 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM24O75264 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM24O75264 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM24O75264 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM24O75264 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM24O75264 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM24O75264 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM24O75264 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM24O75264 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM24O75264 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM24O75264 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM24O75264 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM24O75264 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM24O75264 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM24O75264 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM24O75264 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM24O75264 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM24O75264 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM24O75264 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM24O75264 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM24O75264 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM24O75264 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM24O75264 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM24O75264 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM24O75264 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SMIM24O75264 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM24O75264 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SMIM24O75264 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM24O75264 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SMIM24O75264 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM24O75264 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SMIM24O75264 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SMIM24O75264 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM24O75264 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM24O75264 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SMIM24O75264 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SMIM24O75264 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM24O75264 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SMIM24O75264 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SMIM24O75264 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms