Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC37.02■■■■□ 3.52
LRP5O75197 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
LRP5O75197 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRP5O75197 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
LRP5O75197 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRP5O75197 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
LRP5O75197 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
LRP5O75197 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
LRP5O75197 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
LRP5O75197 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
LRP5O75197 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRP5O75197 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRP5O75197 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRP5O75197 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC36.92■■■■□ 3.5
LRP5O75197 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC36.89■■■■□ 3.5
LRP5O75197 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
LRP5O75197 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
LRP5O75197 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP5O75197 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
LRP5O75197 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
LRP5O75197 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
LRP5O75197 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRP5O75197 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC36.81■■■■□ 3.48
LRP5O75197 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LRP5O75197 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
LRP5O75197 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
LRP5O75197 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC36.77■■■■□ 3.48
LRP5O75197 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
LRP5O75197 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
LRP5O75197 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LRP5O75197 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LRP5O75197 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
LRP5O75197 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
LRP5O75197 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
LRP5O75197 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
LRP5O75197 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
LRP5O75197 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
LRP5O75197 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LRP5O75197 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
LRP5O75197 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
LRP5O75197 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
LRP5O75197 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
LRP5O75197 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
LRP5O75197 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC36.54■■■■□ 3.44
LRP5O75197 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.49■■■■□ 3.43
LRP5O75197 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.48■■■■□ 3.43
LRP5O75197 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
LRP5O75197 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRP5O75197 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
LRP5O75197 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
LRP5O75197 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
LRP5O75197 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
LRP5O75197 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC36.33■■■■□ 3.41
LRP5O75197 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
LRP5O75197 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
LRP5O75197 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
LRP5O75197 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
LRP5O75197 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRP5O75197 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRP5O75197 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRP5O75197 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRP5O75197 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRP5O75197 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
LRP5O75197 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRP5O75197 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
LRP5O75197 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.39
LRP5O75197 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
LRP5O75197 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
LRP5O75197 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
LRP5O75197 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
LRP5O75197 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRP5O75197 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
LRP5O75197 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRP5O75197 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
LRP5O75197 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRP5O75197 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRP5O75197 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRP5O75197 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRP5O75197 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
LRP5O75197 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
LRP5O75197 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
LRP5O75197 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRP5O75197 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
LRP5O75197 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRP5O75197 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
LRP5O75197 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRP5O75197 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
LRP5O75197 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
LRP5O75197 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
LRP5O75197 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LRP5O75197 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
LRP5O75197 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
LRP5O75197 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC35.93■■■■□ 3.34
LRP5O75197 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRP5O75197 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
LRP5O75197 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC35.91■■■■□ 3.34
LRP5O75197 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRP5O75197 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
LRP5O75197 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC35.9■■■■□ 3.34
LRP5O75197 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms