Protein–RNA interactions for Protein: O75164

KDM4A, Lysine-specific demethylase 4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,064 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4AO75164 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM4AO75164 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
KDM4AO75164 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
KDM4AO75164 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM4AO75164 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM4AO75164 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
KDM4AO75164 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
KDM4AO75164 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
KDM4AO75164 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM4AO75164 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC32.94■■■□□ 2.86
KDM4AO75164 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM4AO75164 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
KDM4AO75164 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
KDM4AO75164 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KDM4AO75164 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KDM4AO75164 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
KDM4AO75164 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM4AO75164 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM4AO75164 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM4AO75164 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM4AO75164 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.86■■■□□ 2.85
KDM4AO75164 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.84■■■□□ 2.85
KDM4AO75164 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
KDM4AO75164 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
KDM4AO75164 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM4AO75164 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM4AO75164 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
KDM4AO75164 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM4AO75164 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM4AO75164 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM4AO75164 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM4AO75164 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM4AO75164 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM4AO75164 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM4AO75164 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KDM4AO75164 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM4AO75164 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM4AO75164 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM4AO75164 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM4AO75164 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM4AO75164 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM4AO75164 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM4AO75164 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM4AO75164 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM4AO75164 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM4AO75164 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM4AO75164 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM4AO75164 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM4AO75164 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
KDM4AO75164 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM4AO75164 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM4AO75164 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
KDM4AO75164 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
KDM4AO75164 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
KDM4AO75164 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
KDM4AO75164 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
KDM4AO75164 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM4AO75164 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM4AO75164 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
KDM4AO75164 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM4AO75164 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM4AO75164 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
KDM4AO75164 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
KDM4AO75164 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
KDM4AO75164 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM4AO75164 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM4AO75164 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM4AO75164 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
KDM4AO75164 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM4AO75164 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KDM4AO75164 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KDM4AO75164 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
KDM4AO75164 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM4AO75164 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
KDM4AO75164 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms