Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.81■■■□□ 2.36
SRGAP2O75044 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SRGAP2O75044 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SRGAP2O75044 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SRGAP2O75044 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SRGAP2O75044 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SRGAP2O75044 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SRGAP2O75044 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SRGAP2O75044 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SRGAP2O75044 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
SRGAP2O75044 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SRGAP2O75044 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SRGAP2O75044 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
SRGAP2O75044 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SRGAP2O75044 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP2O75044 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SRGAP2O75044 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRGAP2O75044 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SRGAP2O75044 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SRGAP2O75044 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRGAP2O75044 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SRGAP2O75044 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP2O75044 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP2O75044 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SRGAP2O75044 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SRGAP2O75044 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP2O75044 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SRGAP2O75044 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SRGAP2O75044 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SRGAP2O75044 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP2O75044 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SRGAP2O75044 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRGAP2O75044 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SRGAP2O75044 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SRGAP2O75044 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP2O75044 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SRGAP2O75044 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP2O75044 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SRGAP2O75044 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SRGAP2O75044 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SRGAP2O75044 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SRGAP2O75044 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
SRGAP2O75044 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
SRGAP2O75044 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP2O75044 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
SRGAP2O75044 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRGAP2O75044 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRGAP2O75044 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
SRGAP2O75044 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP2O75044 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
SRGAP2O75044 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP2O75044 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SRGAP2O75044 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP2O75044 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
SRGAP2O75044 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
SRGAP2O75044 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SRGAP2O75044 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms