Protein–RNA interactions for Protein: O60494

CUBN, Cubilin, humanhuman

Predictions only

Length 3,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUBNO60494 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUBNO60494 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CUBNO60494 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUBNO60494 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CUBNO60494 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CUBNO60494 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CUBNO60494 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CUBNO60494 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUBNO60494 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CUBNO60494 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CUBNO60494 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CUBNO60494 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CUBNO60494 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CUBNO60494 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUBNO60494 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CUBNO60494 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CUBNO60494 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUBNO60494 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CUBNO60494 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUBNO60494 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CUBNO60494 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CUBNO60494 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CUBNO60494 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CUBNO60494 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUBNO60494 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CUBNO60494 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CUBNO60494 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUBNO60494 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CUBNO60494 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUBNO60494 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUBNO60494 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CUBNO60494 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CUBNO60494 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUBNO60494 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUBNO60494 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CUBNO60494 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUBNO60494 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUBNO60494 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CUBNO60494 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUBNO60494 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUBNO60494 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CUBNO60494 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CUBNO60494 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUBNO60494 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUBNO60494 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CUBNO60494 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CUBNO60494 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CUBNO60494 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CUBNO60494 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CUBNO60494 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CUBNO60494 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CUBNO60494 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CUBNO60494 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CUBNO60494 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CUBNO60494 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUBNO60494 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CUBNO60494 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUBNO60494 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CUBNO60494 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CUBNO60494 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CUBNO60494 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUBNO60494 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CUBNO60494 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUBNO60494 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUBNO60494 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CUBNO60494 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CUBNO60494 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CUBNO60494 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUBNO60494 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUBNO60494 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUBNO60494 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CUBNO60494 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CUBNO60494 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CUBNO60494 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUBNO60494 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CUBNO60494 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUBNO60494 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CUBNO60494 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CUBNO60494 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUBNO60494 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUBNO60494 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CUBNO60494 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUBNO60494 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CUBNO60494 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CUBNO60494 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CUBNO60494 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CUBNO60494 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUBNO60494 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUBNO60494 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUBNO60494 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CUBNO60494 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CUBNO60494 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUBNO60494 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUBNO60494 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CUBNO60494 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CUBNO60494 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CUBNO60494 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUBNO60494 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CUBNO60494 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CUBNO60494 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms