Protein–RNA interactions for Protein: O60313

OPA1, Dynamin-like 120 kDa protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPA1O60313 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
OPA1O60313 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
OPA1O60313 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
OPA1O60313 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
OPA1O60313 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OPA1O60313 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
OPA1O60313 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
OPA1O60313 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
OPA1O60313 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
OPA1O60313 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OPA1O60313 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
OPA1O60313 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OPA1O60313 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
OPA1O60313 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
OPA1O60313 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.22
OPA1O60313 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
OPA1O60313 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
OPA1O60313 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
OPA1O60313 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPA1O60313 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPA1O60313 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
OPA1O60313 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
OPA1O60313 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
OPA1O60313 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
OPA1O60313 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
OPA1O60313 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OPA1O60313 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
OPA1O60313 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
OPA1O60313 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
OPA1O60313 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
OPA1O60313 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
OPA1O60313 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
OPA1O60313 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
OPA1O60313 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
OPA1O60313 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
OPA1O60313 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
OPA1O60313 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
OPA1O60313 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
OPA1O60313 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
OPA1O60313 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
OPA1O60313 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
OPA1O60313 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OPA1O60313 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OPA1O60313 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OPA1O60313 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
OPA1O60313 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
OPA1O60313 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
OPA1O60313 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
OPA1O60313 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
OPA1O60313 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OPA1O60313 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
OPA1O60313 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
OPA1O60313 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
OPA1O60313 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
OPA1O60313 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
OPA1O60313 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
OPA1O60313 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
OPA1O60313 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
OPA1O60313 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OPA1O60313 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OPA1O60313 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
OPA1O60313 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
OPA1O60313 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
OPA1O60313 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
OPA1O60313 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
OPA1O60313 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
OPA1O60313 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OPA1O60313 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OPA1O60313 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
OPA1O60313 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OPA1O60313 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
OPA1O60313 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OPA1O60313 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OPA1O60313 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
OPA1O60313 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
OPA1O60313 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
OPA1O60313 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OPA1O60313 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
OPA1O60313 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
OPA1O60313 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OPA1O60313 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OPA1O60313 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OPA1O60313 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
OPA1O60313 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
OPA1O60313 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
OPA1O60313 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
OPA1O60313 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
OPA1O60313 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OPA1O60313 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OPA1O60313 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OPA1O60313 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OPA1O60313 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OPA1O60313 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OPA1O60313 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OPA1O60313 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OPA1O60313 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
OPA1O60313 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
OPA1O60313 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OPA1O60313 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OPA1O60313 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms