Protein–RNA interactions for Protein: O60260

PRKN, E3 ubiquitin-protein ligase parkin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKNO60260 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRKNO60260 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRKNO60260 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKNO60260 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRKNO60260 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKNO60260 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRKNO60260 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRKNO60260 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRKNO60260 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PRKNO60260 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRKNO60260 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRKNO60260 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKNO60260 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRKNO60260 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PRKNO60260 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKNO60260 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKNO60260 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRKNO60260 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRKNO60260 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKNO60260 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRKNO60260 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRKNO60260 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRKNO60260 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKNO60260 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKNO60260 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRKNO60260 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKNO60260 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKNO60260 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKNO60260 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRKNO60260 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRKNO60260 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKNO60260 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKNO60260 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRKNO60260 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKNO60260 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PRKNO60260 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKNO60260 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKNO60260 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PRKNO60260 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PRKNO60260 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKNO60260 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKNO60260 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PRKNO60260 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKNO60260 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PRKNO60260 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKNO60260 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PRKNO60260 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKNO60260 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKNO60260 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKNO60260 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PRKNO60260 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKNO60260 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKNO60260 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PRKNO60260 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKNO60260 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKNO60260 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PRKNO60260 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PRKNO60260 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKNO60260 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PRKNO60260 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKNO60260 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PRKNO60260 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKNO60260 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKNO60260 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKNO60260 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PRKNO60260 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKNO60260 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PRKNO60260 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PRKNO60260 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKNO60260 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PRKNO60260 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKNO60260 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKNO60260 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PRKNO60260 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PRKNO60260 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PRKNO60260 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKNO60260 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKNO60260 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKNO60260 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKNO60260 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PRKNO60260 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKNO60260 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PRKNO60260 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKNO60260 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PRKNO60260 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKNO60260 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PRKNO60260 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRKNO60260 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKNO60260 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRKNO60260 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRKNO60260 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRKNO60260 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKNO60260 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKNO60260 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKNO60260 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKNO60260 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKNO60260 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKNO60260 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKNO60260 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PRKNO60260 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms