Protein–RNA interactions for Protein: O43933

PEX1, Peroxisome biogenesis factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX1O43933 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX1O43933 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PEX1O43933 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PEX1O43933 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX1O43933 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX1O43933 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PEX1O43933 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PEX1O43933 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PEX1O43933 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PEX1O43933 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PEX1O43933 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PEX1O43933 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX1O43933 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX1O43933 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX1O43933 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX1O43933 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PEX1O43933 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX1O43933 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PEX1O43933 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PEX1O43933 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX1O43933 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PEX1O43933 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX1O43933 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PEX1O43933 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PEX1O43933 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX1O43933 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PEX1O43933 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PEX1O43933 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PEX1O43933 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PEX1O43933 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PEX1O43933 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PEX1O43933 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
PEX1O43933 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PEX1O43933 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PEX1O43933 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX1O43933 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PEX1O43933 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PEX1O43933 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PEX1O43933 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PEX1O43933 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PEX1O43933 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PEX1O43933 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX1O43933 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PEX1O43933 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PEX1O43933 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PEX1O43933 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PEX1O43933 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX1O43933 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PEX1O43933 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX1O43933 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PEX1O43933 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PEX1O43933 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PEX1O43933 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
PEX1O43933 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PEX1O43933 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX1O43933 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX1O43933 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PEX1O43933 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX1O43933 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX1O43933 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PEX1O43933 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PEX1O43933 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PEX1O43933 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PEX1O43933 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PEX1O43933 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PEX1O43933 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX1O43933 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX1O43933 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX1O43933 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
PEX1O43933 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
PEX1O43933 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PEX1O43933 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PEX1O43933 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PEX1O43933 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PEX1O43933 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PEX1O43933 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PEX1O43933 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PEX1O43933 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PEX1O43933 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PEX1O43933 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX1O43933 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX1O43933 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX1O43933 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PEX1O43933 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX1O43933 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PEX1O43933 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PEX1O43933 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PEX1O43933 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PEX1O43933 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PEX1O43933 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX1O43933 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX1O43933 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PEX1O43933 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
PEX1O43933 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX1O43933 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX1O43933 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PEX1O43933 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX1O43933 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PEX1O43933 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
PEX1O43933 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms