Protein–RNA interactions for Protein: O43772

SLC25A20, Mitochondrial carnitine/acylcarnitine carrier protein, humanhuman

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A20O43772 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
SLC25A20O43772 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
SLC25A20O43772 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC25A20O43772 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SLC25A20O43772 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC25A20O43772 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SLC25A20O43772 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A20O43772 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SLC25A20O43772 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A20O43772 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A20O43772 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SLC25A20O43772 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A20O43772 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SLC25A20O43772 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A20O43772 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SLC25A20O43772 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A20O43772 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A20O43772 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
SLC25A20O43772 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A20O43772 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A20O43772 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
SLC25A20O43772 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A20O43772 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
SLC25A20O43772 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
SLC25A20O43772 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
SLC25A20O43772 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
SLC25A20O43772 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A20O43772 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A20O43772 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
SLC25A20O43772 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A20O43772 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A20O43772 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SLC25A20O43772 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC25A20O43772 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SLC25A20O43772 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A20O43772 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC25A20O43772 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLC25A20O43772 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLC25A20O43772 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLC25A20O43772 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms