Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HTRA2O43464 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HTRA2O43464 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HTRA2O43464 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTRA2O43464 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HTRA2O43464 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HTRA2O43464 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HTRA2O43464 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTRA2O43464 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HTRA2O43464 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HTRA2O43464 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HTRA2O43464 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTRA2O43464 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTRA2O43464 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTRA2O43464 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTRA2O43464 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HTRA2O43464 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HTRA2O43464 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
HTRA2O43464 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HTRA2O43464 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HTRA2O43464 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HTRA2O43464 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTRA2O43464 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HTRA2O43464 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTRA2O43464 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTRA2O43464 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTRA2O43464 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
HTRA2O43464 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HTRA2O43464 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
HTRA2O43464 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HTRA2O43464 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
HTRA2O43464 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTRA2O43464 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
HTRA2O43464 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTRA2O43464 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTRA2O43464 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HTRA2O43464 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
HTRA2O43464 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
HTRA2O43464 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
HTRA2O43464 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
HTRA2O43464 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HTRA2O43464 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HTRA2O43464 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
HTRA2O43464 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
HTRA2O43464 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTRA2O43464 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
HTRA2O43464 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HTRA2O43464 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
HTRA2O43464 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
HTRA2O43464 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HTRA2O43464 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HTRA2O43464 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
HTRA2O43464 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
HTRA2O43464 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTRA2O43464 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTRA2O43464 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTRA2O43464 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTRA2O43464 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTRA2O43464 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HTRA2O43464 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HTRA2O43464 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HTRA2O43464 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTRA2O43464 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HTRA2O43464 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HTRA2O43464 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HTRA2O43464 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HTRA2O43464 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HTRA2O43464 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTRA2O43464 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.52■■■□□ 2
HTRA2O43464 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HTRA2O43464 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HTRA2O43464 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTRA2O43464 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms