Protein–RNA interactions for Protein: O43301

HSPA12A, Heat shock 70 kDa protein 12A, humanhuman

Predictions only

Length 675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA12AO43301 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA12AO43301 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA12AO43301 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HSPA12AO43301 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HSPA12AO43301 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HSPA12AO43301 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPA12AO43301 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HSPA12AO43301 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HSPA12AO43301 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA12AO43301 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA12AO43301 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HSPA12AO43301 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HSPA12AO43301 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA12AO43301 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HSPA12AO43301 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HSPA12AO43301 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HSPA12AO43301 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HSPA12AO43301 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA12AO43301 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA12AO43301 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA12AO43301 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HSPA12AO43301 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HSPA12AO43301 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HSPA12AO43301 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPA12AO43301 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HSPA12AO43301 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSPA12AO43301 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HSPA12AO43301 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSPA12AO43301 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HSPA12AO43301 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPA12AO43301 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HSPA12AO43301 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HSPA12AO43301 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HSPA12AO43301 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HSPA12AO43301 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HSPA12AO43301 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HSPA12AO43301 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA12AO43301 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HSPA12AO43301 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA12AO43301 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HSPA12AO43301 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HSPA12AO43301 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HSPA12AO43301 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA12AO43301 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HSPA12AO43301 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA12AO43301 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HSPA12AO43301 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HSPA12AO43301 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HSPA12AO43301 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms