Protein–RNA interactions for Protein: O15524

SOCS1, Suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1O15524 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOCS1O15524 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SOCS1O15524 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOCS1O15524 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SOCS1O15524 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOCS1O15524 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SOCS1O15524 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOCS1O15524 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SOCS1O15524 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SOCS1O15524 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SOCS1O15524 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SOCS1O15524 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOCS1O15524 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOCS1O15524 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SOCS1O15524 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SOCS1O15524 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SOCS1O15524 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SOCS1O15524 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOCS1O15524 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SOCS1O15524 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SOCS1O15524 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SOCS1O15524 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SOCS1O15524 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SOCS1O15524 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SOCS1O15524 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SOCS1O15524 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SOCS1O15524 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOCS1O15524 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOCS1O15524 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SOCS1O15524 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SOCS1O15524 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOCS1O15524 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SOCS1O15524 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SOCS1O15524 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SOCS1O15524 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOCS1O15524 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SOCS1O15524 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOCS1O15524 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SOCS1O15524 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOCS1O15524 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SOCS1O15524 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SOCS1O15524 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOCS1O15524 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOCS1O15524 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SOCS1O15524 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SOCS1O15524 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
SOCS1O15524 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SOCS1O15524 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SOCS1O15524 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SOCS1O15524 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms