Protein–RNA interactions for Protein: O15394

NCAM2, Neural cell adhesion molecule 2, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAM2O15394 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NCAM2O15394 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCAM2O15394 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCAM2O15394 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NCAM2O15394 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAM2O15394 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAM2O15394 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NCAM2O15394 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
NCAM2O15394 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NCAM2O15394 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NCAM2O15394 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCAM2O15394 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
NCAM2O15394 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NCAM2O15394 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NCAM2O15394 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NCAM2O15394 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NCAM2O15394 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NCAM2O15394 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAM2O15394 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NCAM2O15394 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAM2O15394 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NCAM2O15394 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NCAM2O15394 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAM2O15394 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAM2O15394 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAM2O15394 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NCAM2O15394 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NCAM2O15394 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAM2O15394 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NCAM2O15394 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCAM2O15394 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NCAM2O15394 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAM2O15394 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NCAM2O15394 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NCAM2O15394 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29■■■□□ 2.23
NCAM2O15394 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
NCAM2O15394 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NCAM2O15394 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCAM2O15394 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NCAM2O15394 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
NCAM2O15394 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
NCAM2O15394 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
NCAM2O15394 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
NCAM2O15394 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCAM2O15394 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NCAM2O15394 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NCAM2O15394 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAM2O15394 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAM2O15394 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
NCAM2O15394 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCAM2O15394 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NCAM2O15394 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NCAM2O15394 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAM2O15394 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NCAM2O15394 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NCAM2O15394 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
NCAM2O15394 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
NCAM2O15394 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms