Protein–RNA interactions for Protein: O15060

ZBTB39, Zinc finger and BTB domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBTB39O15060 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBTB39O15060 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZBTB39O15060 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZBTB39O15060 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZBTB39O15060 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
ZBTB39O15060 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZBTB39O15060 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZBTB39O15060 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBTB39O15060 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBTB39O15060 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
ZBTB39O15060 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZBTB39O15060 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZBTB39O15060 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZBTB39O15060 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZBTB39O15060 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZBTB39O15060 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
ZBTB39O15060 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
ZBTB39O15060 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZBTB39O15060 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZBTB39O15060 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZBTB39O15060 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZBTB39O15060 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
ZBTB39O15060 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZBTB39O15060 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZBTB39O15060 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZBTB39O15060 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
ZBTB39O15060 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ZBTB39O15060 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZBTB39O15060 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZBTB39O15060 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZBTB39O15060 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZBTB39O15060 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZBTB39O15060 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
ZBTB39O15060 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZBTB39O15060 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZBTB39O15060 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZBTB39O15060 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZBTB39O15060 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZBTB39O15060 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZBTB39O15060 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZBTB39O15060 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZBTB39O15060 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ZBTB39O15060 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ZBTB39O15060 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
ZBTB39O15060 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBTB39O15060 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBTB39O15060 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBTB39O15060 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ZBTB39O15060 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
ZBTB39O15060 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
ZBTB39O15060 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
ZBTB39O15060 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZBTB39O15060 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
ZBTB39O15060 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
ZBTB39O15060 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
ZBTB39O15060 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ZBTB39O15060 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
ZBTB39O15060 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
ZBTB39O15060 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
ZBTB39O15060 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
ZBTB39O15060 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZBTB39O15060 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
ZBTB39O15060 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
ZBTB39O15060 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
ZBTB39O15060 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
ZBTB39O15060 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBTB39O15060 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBTB39O15060 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBTB39O15060 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ZBTB39O15060 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZBTB39O15060 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ZBTB39O15060 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBTB39O15060 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBTB39O15060 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBTB39O15060 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBTB39O15060 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ZBTB39O15060 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms