Protein–RNA interactions for Protein: O14827

RASGRF2, Ras-specific guanine nucleotide-releasing factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGRF2O14827 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASGRF2O14827 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
RASGRF2O14827 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
RASGRF2O14827 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASGRF2O14827 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASGRF2O14827 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
RASGRF2O14827 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RASGRF2O14827 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RASGRF2O14827 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RASGRF2O14827 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
RASGRF2O14827 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RASGRF2O14827 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASGRF2O14827 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RASGRF2O14827 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RASGRF2O14827 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RASGRF2O14827 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASGRF2O14827 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RASGRF2O14827 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RASGRF2O14827 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RASGRF2O14827 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RASGRF2O14827 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
RASGRF2O14827 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RASGRF2O14827 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASGRF2O14827 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASGRF2O14827 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RASGRF2O14827 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF2O14827 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF2O14827 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RASGRF2O14827 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASGRF2O14827 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
RASGRF2O14827 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASGRF2O14827 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RASGRF2O14827 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RASGRF2O14827 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF2O14827 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
RASGRF2O14827 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASGRF2O14827 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
RASGRF2O14827 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RASGRF2O14827 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
RASGRF2O14827 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASGRF2O14827 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
RASGRF2O14827 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
RASGRF2O14827 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RASGRF2O14827 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RASGRF2O14827 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
RASGRF2O14827 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RASGRF2O14827 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
RASGRF2O14827 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RASGRF2O14827 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RASGRF2O14827 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RASGRF2O14827 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASGRF2O14827 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RASGRF2O14827 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASGRF2O14827 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASGRF2O14827 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RASGRF2O14827 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
RASGRF2O14827 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
RASGRF2O14827 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RASGRF2O14827 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASGRF2O14827 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASGRF2O14827 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RASGRF2O14827 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RASGRF2O14827 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RASGRF2O14827 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RASGRF2O14827 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASGRF2O14827 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASGRF2O14827 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASGRF2O14827 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RASGRF2O14827 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RASGRF2O14827 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RASGRF2O14827 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RASGRF2O14827 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RASGRF2O14827 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RASGRF2O14827 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms