Protein–RNA interactions for Protein: O14579

COPE, Coatomer subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPEO14579 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
COPEO14579 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
COPEO14579 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPEO14579 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
COPEO14579 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
COPEO14579 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPEO14579 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPEO14579 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
COPEO14579 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
COPEO14579 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COPEO14579 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
COPEO14579 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
COPEO14579 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
COPEO14579 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPEO14579 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
COPEO14579 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPEO14579 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
COPEO14579 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPEO14579 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
COPEO14579 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
COPEO14579 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
COPEO14579 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPEO14579 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
COPEO14579 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
COPEO14579 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
COPEO14579 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
COPEO14579 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COPEO14579 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COPEO14579 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
COPEO14579 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.56■■■□□ 2
COPEO14579 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
COPEO14579 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
COPEO14579 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPEO14579 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
COPEO14579 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
COPEO14579 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.51■■■□□ 2
COPEO14579 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
COPEO14579 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPEO14579 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
COPEO14579 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPEO14579 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPEO14579 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPEO14579 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
COPEO14579 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
COPEO14579 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
COPEO14579 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
COPEO14579 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
COPEO14579 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
COPEO14579 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPEO14579 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPEO14579 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
COPEO14579 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPEO14579 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPEO14579 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
COPEO14579 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPEO14579 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
COPEO14579 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPEO14579 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPEO14579 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
COPEO14579 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
COPEO14579 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
COPEO14579 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
COPEO14579 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
COPEO14579 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COPEO14579 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
COPEO14579 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
COPEO14579 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
COPEO14579 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPEO14579 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPEO14579 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
COPEO14579 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
COPEO14579 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COPEO14579 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
COPEO14579 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
COPEO14579 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
COPEO14579 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
COPEO14579 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
COPEO14579 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPEO14579 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
COPEO14579 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPEO14579 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
COPEO14579 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPEO14579 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
COPEO14579 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COPEO14579 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COPEO14579 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPEO14579 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COPEO14579 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPEO14579 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COPEO14579 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COPEO14579 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPEO14579 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COPEO14579 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPEO14579 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
COPEO14579 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPEO14579 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPEO14579 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
COPEO14579 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPEO14579 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
COPEO14579 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms