Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
E2F3O00716 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
E2F3O00716 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
E2F3O00716 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E2F3O00716 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
E2F3O00716 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
E2F3O00716 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
E2F3O00716 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
E2F3O00716 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
E2F3O00716 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
E2F3O00716 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
E2F3O00716 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
E2F3O00716 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
E2F3O00716 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
E2F3O00716 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
E2F3O00716 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F3O00716 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F3O00716 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
E2F3O00716 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F3O00716 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F3O00716 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
E2F3O00716 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F3O00716 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F3O00716 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F3O00716 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
E2F3O00716 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E2F3O00716 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
E2F3O00716 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
E2F3O00716 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
E2F3O00716 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
E2F3O00716 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
E2F3O00716 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E2F3O00716 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27■■□□□ 1.91
E2F3O00716 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
E2F3O00716 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
E2F3O00716 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
E2F3O00716 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F3O00716 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
E2F3O00716 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F3O00716 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
E2F3O00716 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
E2F3O00716 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
E2F3O00716 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F3O00716 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F3O00716 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F3O00716 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F3O00716 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
E2F3O00716 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
E2F3O00716 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E2F3O00716 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
E2F3O00716 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
E2F3O00716 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
E2F3O00716 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F3O00716 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F3O00716 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
E2F3O00716 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
E2F3O00716 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
E2F3O00716 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
E2F3O00716 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F3O00716 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F3O00716 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
E2F3O00716 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F3O00716 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
E2F3O00716 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
E2F3O00716 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F3O00716 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F3O00716 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
E2F3O00716 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
E2F3O00716 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E2F3O00716 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
E2F3O00716 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
E2F3O00716 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
E2F3O00716 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F3O00716 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
E2F3O00716 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
E2F3O00716 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
E2F3O00716 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
E2F3O00716 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
E2F3O00716 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F3O00716 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F3O00716 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F3O00716 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
E2F3O00716 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
E2F3O00716 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
E2F3O00716 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
E2F3O00716 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
E2F3O00716 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F3O00716 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F3O00716 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F3O00716 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
E2F3O00716 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
E2F3O00716 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
E2F3O00716 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
E2F3O00716 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F3O00716 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F3O00716 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
E2F3O00716 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F3O00716 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
E2F3O00716 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
E2F3O00716 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms