Protein–RNA interactions for Protein: O00635

TRIM38, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM38, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM38O00635 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TRIM38O00635 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM38O00635 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM38O00635 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM38O00635 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM38O00635 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM38O00635 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TRIM38O00635 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TRIM38O00635 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TRIM38O00635 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TRIM38O00635 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM38O00635 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM38O00635 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM38O00635 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TRIM38O00635 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM38O00635 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TRIM38O00635 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM38O00635 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TRIM38O00635 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM38O00635 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TRIM38O00635 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM38O00635 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TRIM38O00635 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM38O00635 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TRIM38O00635 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TRIM38O00635 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TRIM38O00635 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM38O00635 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TRIM38O00635 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRIM38O00635 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM38O00635 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRIM38O00635 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRIM38O00635 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM38O00635 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRIM38O00635 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRIM38O00635 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRIM38O00635 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRIM38O00635 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM38O00635 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRIM38O00635 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRIM38O00635 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TRIM38O00635 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM38O00635 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM38O00635 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
TRIM38O00635 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
TRIM38O00635 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.55■■■□□ 2
TRIM38O00635 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM38O00635 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRIM38O00635 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM38O00635 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM38O00635 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TRIM38O00635 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
TRIM38O00635 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM38O00635 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRIM38O00635 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM38O00635 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRIM38O00635 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM38O00635 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM38O00635 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRIM38O00635 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRIM38O00635 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRIM38O00635 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM38O00635 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRIM38O00635 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM38O00635 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
TRIM38O00635 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM38O00635 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM38O00635 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRIM38O00635 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRIM38O00635 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRIM38O00635 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM38O00635 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM38O00635 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRIM38O00635 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM38O00635 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM38O00635 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRIM38O00635 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRIM38O00635 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TRIM38O00635 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TRIM38O00635 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms