Protein–RNA interactions for Protein: O00629

KPNA4, Importin subunit alpha-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA4O00629 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KPNA4O00629 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KPNA4O00629 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KPNA4O00629 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KPNA4O00629 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KPNA4O00629 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
KPNA4O00629 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KPNA4O00629 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
KPNA4O00629 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KPNA4O00629 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KPNA4O00629 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KPNA4O00629 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA4O00629 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA4O00629 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA4O00629 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
KPNA4O00629 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
KPNA4O00629 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
KPNA4O00629 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KPNA4O00629 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
KPNA4O00629 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA4O00629 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA4O00629 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA4O00629 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
KPNA4O00629 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA4O00629 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
KPNA4O00629 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
KPNA4O00629 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA4O00629 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
KPNA4O00629 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KPNA4O00629 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KPNA4O00629 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KPNA4O00629 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KPNA4O00629 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA4O00629 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA4O00629 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA4O00629 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KPNA4O00629 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KPNA4O00629 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KPNA4O00629 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
KPNA4O00629 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
KPNA4O00629 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
KPNA4O00629 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA4O00629 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA4O00629 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
KPNA4O00629 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA4O00629 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
KPNA4O00629 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms