Protein–RNA interactions for Protein: J3QKU1

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QKU1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
J3QKU1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
J3QKU1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
J3QKU1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
J3QKU1 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
J3QKU1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
J3QKU1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
J3QKU1 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
J3QKU1 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
J3QKU1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
J3QKU1 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
J3QKU1 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
J3QKU1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
J3QKU1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
J3QKU1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
J3QKU1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
J3QKU1 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
J3QKU1 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
J3QKU1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
J3QKU1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
J3QKU1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
J3QKU1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
J3QKU1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
J3QKU1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
J3QKU1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
J3QKU1 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
J3QKU1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
J3QKU1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
J3QKU1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
J3QKU1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
J3QKU1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
J3QKU1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
J3QKU1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
J3QKU1 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
J3QKU1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
J3QKU1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
J3QKU1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
J3QKU1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
J3QKU1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
J3QKU1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
J3QKU1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
J3QKU1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
J3QKU1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
J3QKU1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
J3QKU1 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
J3QKU1 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
J3QKU1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
J3QKU1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
J3QKU1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
J3QKU1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
J3QKU1 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
J3QKU1 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
J3QKU1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
J3QKU1 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
J3QKU1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
J3QKU1 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
J3QKU1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
J3QKU1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
J3QKU1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
J3QKU1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
J3QKU1 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
J3QKU1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
J3QKU1 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
J3QKU1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
J3QKU1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
J3QKU1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
J3QKU1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
J3QKU1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
J3QKU1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
J3QKU1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
J3QKU1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
J3QKU1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
J3QKU1 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
J3QKU1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
J3QKU1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
J3QKU1 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
J3QKU1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
J3QKU1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
J3QKU1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
J3QKU1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
J3QKU1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
J3QKU1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
J3QKU1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
J3QKU1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
J3QKU1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
J3QKU1 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
J3QKU1 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
J3QKU1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
J3QKU1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
J3QKU1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
J3QKU1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
J3QKU1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
J3QKU1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
J3QKU1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
J3QKU1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
J3QKU1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
J3QKU1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
J3QKU1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
J3QKU1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
J3QKU1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.1 ms