Protein–RNA interactions for Protein: H7C417

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H7C417 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
H7C417 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H7C417 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
H7C417 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
H7C417 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
H7C417 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
H7C417 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H7C417 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
H7C417 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C417 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
H7C417 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C417 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C417 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
H7C417 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
H7C417 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C417 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C417 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
H7C417 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
H7C417 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H7C417 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
H7C417 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
H7C417 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C417 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
H7C417 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
H7C417 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C417 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C417 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C417 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
H7C417 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C417 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C417 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C417 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
H7C417 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
H7C417 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
H7C417 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C417 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C417 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
H7C417 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
H7C417 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
H7C417 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
H7C417 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C417 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
H7C417 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C417 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
H7C417 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C417 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
H7C417 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
H7C417 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
H7C417 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
H7C417 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C417 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C417 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
H7C417 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C417 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C417 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
H7C417 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C417 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
H7C417 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
H7C417 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C417 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
H7C417 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C417 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C417 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
H7C417 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
H7C417 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
H7C417 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C417 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
H7C417 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H7C417 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
H7C417 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
H7C417 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
H7C417 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C417 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C417 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
H7C417 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
H7C417 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
H7C417 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H7C417 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H7C417 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H7C417 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H7C417 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
H7C417 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H7C417 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H7C417 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H7C417 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H7C417 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H7C417 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
H7C417 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
H7C417 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C417 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C417 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H7C417 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H7C417 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H7C417 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H7C417 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H7C417 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C417 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C417 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C417 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H7C417 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms