Protein–RNA interactions for Protein: H6UMI1

GABARAP, GABARAP-a, humanhuman

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPH6UMI1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABARAPH6UMI1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABARAPH6UMI1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
GABARAPH6UMI1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GABARAPH6UMI1 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABARAPH6UMI1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GABARAPH6UMI1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
GABARAPH6UMI1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABARAPH6UMI1 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GABARAPH6UMI1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
GABARAPH6UMI1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GABARAPH6UMI1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GABARAPH6UMI1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABARAPH6UMI1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABARAPH6UMI1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GABARAPH6UMI1 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABARAPH6UMI1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GABARAPH6UMI1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GABARAPH6UMI1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GABARAPH6UMI1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GABARAPH6UMI1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABARAPH6UMI1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABARAPH6UMI1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GABARAPH6UMI1 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABARAPH6UMI1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GABARAPH6UMI1 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABARAPH6UMI1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GABARAPH6UMI1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GABARAPH6UMI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GABARAPH6UMI1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GABARAPH6UMI1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABARAPH6UMI1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GABARAPH6UMI1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABARAPH6UMI1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABARAPH6UMI1 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GABARAPH6UMI1 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GABARAPH6UMI1 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABARAPH6UMI1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GABARAPH6UMI1 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABARAPH6UMI1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABARAPH6UMI1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GABARAPH6UMI1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABARAPH6UMI1 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABARAPH6UMI1 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GABARAPH6UMI1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABARAPH6UMI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABARAPH6UMI1 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABARAPH6UMI1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABARAPH6UMI1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABARAPH6UMI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABARAPH6UMI1 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABARAPH6UMI1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABARAPH6UMI1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPH6UMI1 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABARAPH6UMI1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABARAPH6UMI1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABARAPH6UMI1 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABARAPH6UMI1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABARAPH6UMI1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GABARAPH6UMI1 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GABARAPH6UMI1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPH6UMI1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPH6UMI1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPH6UMI1 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GABARAPH6UMI1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GABARAPH6UMI1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPH6UMI1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GABARAPH6UMI1 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GABARAPH6UMI1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPH6UMI1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GABARAPH6UMI1 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
GABARAPH6UMI1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPH6UMI1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
GABARAPH6UMI1 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPH6UMI1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GABARAPH6UMI1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GABARAPH6UMI1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPH6UMI1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPH6UMI1 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GABARAPH6UMI1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABARAPH6UMI1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABARAPH6UMI1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GABARAPH6UMI1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GABARAPH6UMI1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms